本发明公开了一种微生物复合菌净化富营养水体的装置，包括河道，河道的两旁为河堤，其中一边的河堤上设有用于沿河堤行驶的小车，小车上设有立柱、卷扬机、微生物复合菌仓，立柱的上端通过铰接轴铰接有水平杆，水平杆的左端底面设有平衡配重块，水平杆的中部设有中间定滑轮，水平杆的右端铰接有滑轮，卷扬机中卷绕有的线缆依次张紧在中间定滑轮和滑轮上并绕过滑轮，线缆的端部设有培育桶，微生物复合菌仓的上部固定有粉末输送泵，粉末输送泵的进料端通接微生物复合菌仓，粉末输送泵的出料口通接布料管，布料管伸入内培育桶中，培育桶在河道上方。它可以促使微生物高效快速繁殖，与外界环境快速适应，结构简单，运行可靠，寿命长，净化效果好。