本发明公开了一种4,5,6-三氯嘧啶的制备方法,属于化学合成技术领域。以4,6-二羟基嘧啶为原料,经溴化后得到中间体4,6-二羟基-5-溴嘧啶,该中间体溶解在溶剂中,在催化剂催化下,与氧氯化磷在80～100℃温度下反应4~18小时得反应液;反应液冷却到零度,用质量浓度为20%的氢氧化钠水溶液调节pH值到6~7,然后用二氯甲烷萃取三次,合并的萃取液用氯化铵饱和溶液洗涤两次,饱和食盐水洗涤两次,有机相用无水硫酸钠干燥,过滤后,浓缩得到目标化合物4,5,6-三氯嘧啶。本发明具有合成工艺简单,合理,转化率高,后处理可行,生产成本低等优点。