本发明公开了一种高亲水性聚酰胺酰亚胺、制备方法及其在多孔膜的应用,属于高分子材料技术领域,将柠檬酸酯和脂肪族二胺按摩尔比1∶0.1～1∶10的比例混合均匀,以柠檬酸酯总重量0.1～10WT%的比例添加催化剂并与反应物混匀,真空减压在加热下,进行缩合聚合反应形成中间体;将上述中间体在50～250℃范围内逐步升温,继续反应,得到所述的高亲水聚酰胺酰亚胺。本发明应用于微孔膜上时,将上述反应物料铺展到玻璃或金属表面,浇铸成一定厚度的液体膜,真空下50～250℃范围内分阶段逐步升温,加热2～24小时形成孔径0.1～2.0微米的多孔膜。本发明制备的产物的亲水性比常规的芳香族聚酰胺酰亚胺高出3～15倍。